Sekolah Pascasarjana berdiri mulai tahun 1996, saat ini memiliki 16 Program Studi, 14 Program Magister (S2) dan 2 Program Doktor (S3). Berikut adalah daftar program studi Sekolah Pascasarjana UMS:
| No | Program Studi | Jenjang Pendidikan/ Akreditasi | Biaya Pendaftaran | SPP per semester | Keterangan |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Magister Ilmu Hukum | (S2) - B | Rp 500.000,- (lima ratus tibu rupiah) | Rp 8.250.000 | *Catatan: Apabila terdapat perbedaan data dengan saat registrasi di Loket Pendaftaran UMS, maka data yang valid adalah data Loket Pendaftaran |
| 2 | Magister Hukum Ekonommi Syariah/ Hukum Islam | (S2) - B | Rp 7.500.000 | ||
| 3 | Magister Pendidikan Islam | (S2) - A | Rp 7.500.000 | ||
| 4 | Magister Pendidikan Bahasa Indonesia | (S2) - B | Rp 7.500.000 | ||
| 5 | Magister Pendidikan Bahasa Inggris | (S2) - C | Rp 7.500.000 | ||
| 6 | Magister Administrasi Pendidikan | (S2) - A | Rp 8.000.000 | ||
| 7 | Magister Pendidikan Dasar | (S2) - C | Rp 7.500.000 | ||
| 8 | Magister Farmasi | (S2) - B | Rp 9.750.000 | ||
| 9 | Magister Manajemen | (S2) - A | Rp 8.250.000 | ||
| 10 | Magister Akuntansi | (S2) - B | Rp 8.000.000 | ||
| 11 | Magister Psikologi | (S2) - B | Rp 8.500.000 | ||
| 12 | Magister Teknik Sipil | (S2) - A | Rp 8.000.000 | ||
| 13 | Magister Teknik Mesin | (S2) - B | Rp 8.000.000 | ||
| 14 | Magister Teknik Kimia | (S2) - C | Rp 7.000.000 | ||
| 15 | Doktor Ilmu Hukum | (S3) - B | Rp 1.000.000,- (satu juta rupiah) | Rp 16.500.000 | Bagi mahasiswa yang menulis Jurnal Scopus, mahasiswa tidak perlu ujian terbuka |
| 16 | Doktor Pendidikan Agama Islam | (S3) - C | Rp 15.000.000 | Biaya sudah mencakup SPP, Bimbingan Disertasi, Seminar Proposal, Seminar Hasil dan Ujian Tertutup |
Untuk informasi selengkapnya tentang prosedur pendaftaran, biaya dan masa perkuliahan dapat dilihat melalui url http://sps.ums.ac.id/